Verdes, Liberales y parte de los Socialistas europeos , organizaron una campaña en su contra que parece condenada a no fructificar. Algunos le achacan su incapacidad para ratificar el Tratado de Lisboa. Daniel Cohn-Bendit, político francés, recordó a mediados de junio que si hubiera entrado ya en vigor, la Eurocámara tendría más competencias en la selección de los candidatos y en su aprobación definitiva. "¿Por qué Barroso, gran defensor del Tratado de Lisboa, quiere ser nombrado con las reglas de un Tratado de Niza a punto de caducar?", se llegó a preguntar.
Los Verdes critican también su falta de firmeza ante los grandes países o que no apoyase legislar los excesos que llevaron a la crisis económica. Sin embargo no fueron capaces de plantear una alternativa. "Hay personas capacitadas, pero sólo emergerán cuando hayamos bloqueado a Barroso", concluyó Cohn-Bendit. Y eso, no ha sucedido.