El general, de 60 años, renuncia a uno de los puestos más prestigiosos de las Fuerzas Armadas de Estados Unidos, y deja un rompecabezas para la Casa Blanca y el Pentágono, que deberán encontrarle un reemplazo.
Por el momento, no se ha mencionado ningún nombre para cubrir el puesto dentro de la Organización del Tratado Atlántico Norte (OTAN), actualmente ocupado por James Stavridis, y que tradicionalmente se le otorga a un oficial estadounidense.
"Hoy me encontré con el general John Allen y acepté su petición de retirarse de la Armada para que pueda atender problemas de salud en su familia", informó el presidente estadounidense Barack Obama a través de una declaración escrita.
Allen puso fin, hace diez días, a un despliegue de 19 meses en Kabul, Afganistán, donde dirigió a la coalición internacional (Isaf).
Durante semanas se había especulado sobre la posibilidad de que Allen no aceptara la oferta de Obama para desempeñarse como comandante supremo aliado de la OTAN, incluso luego de que se lo exonerara de responsabilidades en el escándalo que provocó la renuncia del director de la CIA, David Petraeus.
Allen fue objeto de una investigación del Pentágono por supuestos correos electrónicos de tono "inapropiado" enviados a la relacionista pública de Florida Jill Kelly, protagonista del escándalo sexual que provocó la caída del jefe de la CIA.
Sin embargo, el Departamento de Defensa lo exoneró de culpas en el caso y Obama decidió seguir adelante con su nombramiento para la OTAN, que había sido suspendido durante la investigación.
En una entrevista concedida al diario Washington Post, el general explicó que quiere ocuparse de la salud de su esposa, Kathy, quien padece una enfermedad autoinmune.
"En este momento, quiero que ella esté bien. Es tiempo de que me ocupe de mi familia", justificó, asegurando que su renuncia no tiene ninguna relación con la investigación de la que fue objeto.
Obama elogió al general de la Marina por haber presidido un "crecimiento significativo" de las fuerzas de seguridad afganas y una "mayor degradación" de Al Qaida.
"Sobre todo, él se interesa profundamente por los hombres y mujeres uniformados que sirven a nuestra nación -así como sus familias- y estoy agradecido por los sacrificios hechos por su familia al apoyarlo durante su servicio", dijo el presidente.
"John Allen es uno de los mejores jefes militares de Estados Unidos, un verdadero patriota y un hombre a quien aprendí a respetar enormemente. Les deseo lo mejor a él y a su familia, ahora que comienzan un nuevo capítulo de su vida", afirmó Obama, y prometió "continuar el trabajo extraordinario realizado por el general Allen en Afganistán".