Farooq, uno de los fundadores del Muttahida Qaumi Movement (MQM), fue encontrado el jueves por la tarde con heridas en la cabeza y heridas de arma blanca en el barrio de Edgware, al norte de Londres, frente a su domicilio, informaron los medios británicos.
En Pakistán, el primer ministro, Yusuf Raza Gilani, condenó el "asesinato" de Farooq.
Las calles de Karachi estaban vacías. El MQM decretó 10 días de luto y anuló las celebraciones previstas para el cumpleaños de su líder, Altaf Husain, también residente de Gran Bretaña.
El asesinato en Karachi, el mes pasado, de un abogado del MQM, Haider Raza, desencadenó una nueva ola de violencia étnica y política en la ciudad, con un saldo de unas 85 personas muertas.
"Hemos tomado medidas de precaución para asegurarnos de que nadie aproveche la situación para crear episodios de violencia", dijo el jefe de la policía de la ciudad, Fayad Leghari, a la AFP.
Los transportistas y los comerciantes anunciaron que cerraban sus negocios en señal de duelo.
El MQM es el socio de la coalición liderada por el Partido del Pueblo Paquistaní en el poder en la provincia sureña de Sindh, de la que Karachi es la capital.
Fue fundado para una franja de millones de musulmanes que huyeron de India durante la partición sangrienta de la ex colonia británica, en 1947. Representa en Karachi a la parte de la población, mayoritaria, que habla urdu.
Farooq fue elegido diputado dos veces pero tuvo que esconderse en 1992, cuando el gobierno ordenó una ofensiva contra los activistas del partido en Karachi.
El gobierno le acusa de asesinato y tortura, entre otros cargos. Farooq siempre ha asegurado que su inculpación estaba motivada políticamente y reapareció en Gran Bretaña en 1999, donde pidió el estatuto de refugiado político.