A pesar de las polémicas declaraciones hechas con anterioridad al congreso por el alto dirigente de Fatah, Faruk Kaddumi, que indicó que el presidente de la Autoridad Palestina, Mahmud Abbas, era el responsable de la muerte de Arafat junto con Israel, no han sido realizadas acusaciones contra ningún miembro concreto del movimiento durante el Congreso. 
 
En la agenda del miércoles también estuvo la forma en que los responsables de Fatah van a ser elegidos. Debido a que muchos de los delegados del partido procedentes de la Franja de Gaza no pudieron acudir al congreso debido a la prohibición de Hamas, se sugirió que una votación separada sea realizada por los residentes en la Franja con el fin de  no dar una ventaja a los delegados que fueron capaces de acudir a Belén. 
 
Sin embargo, pareció el miércoles como si el Congreso estuviera moviéndose hacia la celebración de unas elecciones en las que participaran los delegados asistentes. Esto dañaría significativamente a los candidatos de la Franja de Gaza. 
 
Este tema será muy probablemente decidido el jueves, cuando sean presentados los diversos candidatos. El antiguo primer ministro palestino Ahmed Qureia inició el martes por la mañana el histórico Sexto Congreso de Fatah.